Neji hyuuga jest uznawany za najzdolniejszego potomka hyuuga co widać po tym że 3,5 roku po ukończeniu akademi zostaje jouninem.neji trafia do bocznej gałęzi klanu hyuuga przez pohodzenie jego ojca ktorego traci przez konflikt konohy z wioską chmur.Po tym neji znienawidził głąwną gałąź i żyje w przekonaniu że los czlowieka jest z góry określony,zmienia zdanie po walce z naruto i po tym jak otrzymuje list jego ojca w którym pisze ze zginął z wlasnej woli(chmury-gakure napadły na posiadlość hyuuga probując porwać hinate jednak ojciec hinaty zabija porywacza,później chmury żądają ciała ojca hinaty i hyuuga postanawia oddać ojca nejiego,bliźniaczego brata hiashiego(ojca hinaty))potym neji zmienia widok na świat.jako czterolatek zostaje przydzielone mu chronienie hinaty.krotki czas po chunnin exam nejiego postanawia trenować Hiashi Hyuuga który w trakcie chunnin exam mówi do swojej młodszej córki:on odzierdziczył największy limit krwi w naszym klanie,jest silniejszy od ciebie.po zostaniu geninem neji trafia do drużyny z rock lee i tenten prowadząną przez maito gai.Kiedy sasuke opuszcza konohe neji wraz z naruto uzumaki,kiba inuzuka,chouchi akimichi i shikamaru nara wyruszają na misje by go sprowadzić do konohy z której neji ledwo uchodzi żywy po starciu z członkiem czwórki dźwięku-Kidoumaru.
Rok po ukończeniu akademii neji przystępuje do chunnin exam w którym gładko przechodzi do walk finałowych w których odpada w 1st rundzie po walce z naruto.Podczas ataku na konohe neji leży w szpitalu po walce z naruto.Sam opanowuje technike Hakkeshou:kaiten,czyli technike którą dotychczas znali tylko przedstawiciele głównej gałęzi,jedną z jego najlepszych technik jest Hakke:rookujuyonshou  która blokuje 64 główne tenketsu oraz jej odmiana blokująca 128 tenketsu.Neji to bez wątpienia jeden z największych geniuszy w naruto.